空氣質量監測子站系統的運營模式主要有兩種，一是自管，即本站的工作人員進行管理，二是托管，即將子站系統委托給有資質和能力的單位進行管理。托管模式是指空氣質量監測公司因為其自身設備較多，但是專業人員較少，則將子站的運行維護工作委托給相關單位，以求降低成本、保障監測質量、提高效率等。托管模式具有兩大方面的優勢：

一是能夠使得空氣監管力度增強，提升監測質量。因為將子站的運行管理工作托付給有實力有資質的運營單位，而空氣質量監測部門所要做的就是對得到的監測數據進行檢查和監督，使得工作的細致度更好，進而提升了監測的質量。

二是能夠充分發揮監測人員的管理優勢。在以往的管理中，監測人員既要進行子站的運行管理，又要對監測數據進行分析，而且監測設備的種類不斷增加也對監測人員的技術提出了更高的要求，造成監測人員負擔過重，甚至導致空氣質量監測質量降低。將子站運行管理托付給其他單位后，監測人員的工作重心主要在空氣質量監測數據的分析上，能夠充分利用自動監測的優點，對管理的實效性進行分析，關注環境污染的變化，提升空氣質量監測效率，進而更好地進行空氣質量管理服務。

托管模式是一種市場化的專業模式，將日常運行工作與監督分析工作進行分工，工作主體不再是同一單位，提升了監測的質量，所以空氣質量監測子站委托管理模式將會成為子站系統管理模式的主要模式。